El Dr. Hell vuelve a Japón y secuestra a Mazinger Z, el cual lo utliliza para atacar al Laboratorio de Investigaciones Fotoatómicas, pero luego Koji Kabuto encuentra a Mazinkaiser un robot que fue construido por su abuelo, el creador de Mazinger Z (Juzo Kabuto), este nuevo robot es mucho más poderoso y grande que el Mazinger Z , y el Gran Mazinger tambien. Koji esta vez necesita aprender a manejar a Mazinkaiser para poder derrotar a los robots del Dr. Hell.

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